中心简介
聚焦科技创新、面向国家重大需求
研究团队
优秀的多组学大数据研究团队
研究方向
前沿的生物医学大数据算法
招生招聘
谱写生物信息智能医学未来
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研究团队
优秀的多组学大数据研究团队
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基因复制事件在脊椎动物进化中普遍存在,并且在获得新基因和新性状方面发挥重要作用。
全基因组复制(WGD)是基因复制的重要来源之一,它可以通过增加基因组的灵活性和复杂性为自然选择提供重要原料。WGD是脊椎动物进化的驱动力,其对物种多样性有很大贡献。
DupScan是研究基因和基因组共线性和WGD的一站式分析平台,用户可以在线分析和预测多种全基因组序列的共线性和WGD模式,为6000多种脊椎动物基因组复制格局提供了高效的在线分析平台。
DupScan通过整合脊椎动物染色体高质量基因组,可以对基因和基因组尺度的共线性区域进行分析和可视化,同时DupScan搭载了全基因组浏览器金额BLAST功能基因染色体定位,支持五类WGD事件:VGD2(vertebrate
genome duplication2),Ars3R(Acipenser-ruthenus-specific 3R),Pss3R(Polyodon-spathula-specific
3R),Ts3R(teleost-specific duplication 3R),Ss4R(salmonid-specific 4R)和Cs4R(carp-specific 4R).
针对实现国家生物医学大数据战略和我国生物医学数据汇集管理与共享利用的重大需求,中心承担了国家“863”计划重大项目“生物大数据开发与利用关键技术研究”项目之大数据核心算法和系统平台建设任务。
该项目获得1.47亿元中央财政经费支持,旨在突破生物医学大数据标准化集成与融合技术;研发生物大数据索引、存储管管理与搜索访问技术;开展针对心血管疾病、肿瘤疾病等重大疾病和区域医疗与健康的医疗大数据处理分析技术;建立国家组学大数据中心,保障国家生物数字主权;开创我国生物医学大数据组织管理与共享利用里程碑式新局面,提升我国生物医学大数据的国际竞争力。