信息安全系是在信息安全专业基础上筹建的。南开大学信息安全专业创建于2003年，是国内首批信息安全专业，重在培养掌握网络攻防、病毒分析、系统安全、软件安全等技术的信息安全技术专业型人才。经过多年发展，已形成了完整教学科研体系。信息安全系是在信息安全专业基础上筹建的。南开大学信息安全专业创建于2003年，是国内首批信息安全专业，重在培养掌握网络攻防、病毒分析、系统安全、软件安全等技术的信息安全技术专业型人才。经过多年发展，已形成了完整教学科研体系。

信息安全系下设信息安全单学位班和“信息安全-法学”双学位试点班。其中，双学位试点班是南开大学特色试点班，设置于2006年，招收理科学生攻读信息安全和法学双学位。信息安全系拥有信息安全二级学科（081205）硕士学位授权点，依托计算机科学与技术一级学科博士学位授予点，形成了本硕博一体的完整培养体系。

信息安全系下设信息安全单学位班和“信息安全-法学”双学位试点班。其中，双学位试点班是南开大学特色试点班，设置于2006年，招收理科学生攻读信息安全和法学双学位。信息安全系拥有信息安全二级学科（081205）硕士学位授权点，依托计算机科学与技术一级学科博士学位授予点，形成了本硕博一体的完整培养体系。