2013年，研究院共发表论文19篇，其中SCI收录论文18篇，总影响因子61.263，平均影响因子3.603，单篇最高影响因子13.231。主要包括《FEMS Microbiology Reviews》1篇（IF:13.231）、《Applied and Environmental Microbiology》1篇（IF：3.778）、《PLoS ONE》5篇（IF：3.73）。
研究院共承担科研课题35项，其中包括新增课题11项、延续课题19项、完成课题7项，总经费3395.075万元，已到位经费2269.955万元。新申请获得自2014年执行的国家自然科学基金面上项目2项，总经费188万元。获授权国内发明专利1项、申请国内发明专利5项。